概要
HyCellは、単一細胞トランスクリプトームの解析を目的とする、約1,610万パラメータの埋め込みモデルです。ヒト細胞の生の遺伝子発現カウントを512次元の埋め込みに変換し、デコーダーで埋め込みから遺伝子発現を推定できます。CZ CELLxGENE Censusのヒト細胞約7,950万個を用い、細胞型ラベルなしで事前学習されています。(raw.githubusercontent.com)
能力・用途
- 凍結したエンコーダーによる細胞のクラスタリング、バッチ間統合、細胞型の注釈転移、細胞状態の比較。
- ラベル付き参照データを使ったファインチューニングによる細胞型注釈。
- 遺伝子発現の復元と、細胞群間の発現変化の分析。(raw.githubusercontent.com)
公式評価では、事前学習から除外した7つのアトラスにおける凍結埋め込みの総合スコアは0.735でした。同じ評価でのStackのスコアは0.736です。この評価は細胞レベルのタスクを対象としています。(raw.githubusercontent.com)
制限・利用条件
- 入力はヒト遺伝子の生の整数カウントです。語彙外の遺伝子は除外されます。公式は高変動遺伝子だけでなく、測定した全遺伝子を入力するよう案内しています。(raw.githubusercontent.com)
- エンコーダーには、発現量の高い遺伝子を最大818個入力します。性別や疾患状態などドナー全体に共通する属性の分析では、細胞ごとの埋め込みをドナーまたはサンプル単位で集約する方法が案内されています。(raw.githubusercontent.com)
- 公開評価の結果は、あらゆるデータセットや臨床用途での性能を保証するものではありません。CPUでも推論できますが、公式はCUDA GPUを推奨しています。(raw.githubusercontent.com)
公開・利用方法
公開日は2026年11月2日です。重み、推論コード、Pythonパッケージ、技術報告書が公開されています。重みはパッケージに含まれ、インストール後はネットワーク接続なしで実行できます。リポジトリのライセンスはApache-2.0です。(github.com)
価格
2026年11月14日確認。Tencent Cloudの中国国内・国際TokenHub公式料金表を確認しましたが、HyCell固有の公式API価格は確認できませんでした。入力・出力それぞれの課金額や課金単位も未確認です。公開重みの利用に必要な計算環境の費用は別途考慮してください。(cloud.tencent.com)